تطلع شعبة الدراسات العليا بمهام تنظيم ومتابعة المسيرة الأكاديمية والإدارية لطلبة الدراسات العليا، بدءًا من مرحلة التقديم وحتى نيل الشهادة. وتشمل مهامها تنسيق آليات القبول، تنظيم الجداول الدراسية، الإشراف على الامتحانات، ومتابعة البحوث والرسائل العلمية، فضلاً عن التنسيق المستمر مع وزارة التعليم العالي بشأن التعليمات والتحديثات المتعلقة بالدراسات العليا.